La antigua sede del Museo, ubicada al lado de la Iglesia de La Veracruz, sigue vinculada activamente al quehacer diario de la entidad. La edificación, donde antes funcionara la primera fábrica de aguardiente de Antioquia y, posteriormente, la Casa de la Moneda, fue habilitada como museo en 1955.

Con el traslado de la sede principal en el Palacio Municipal en el año 2000, la casa comenzó a transformarse en el Ala Experimental del Museo de Antioquia. Desde entonces, se han emprendido distintas obras civiles, necesarias para renovar las viejas estructuras y crear los nuevos espacios que proyecta la institución.

En el Ala Experimental, de ingreso gratuito para todo el público, el Museo ofrece la Biblioteca Jaime Hincapié Santamaría, una sala de cine para 130 personas, las oficinas de la Dirección Cultural, tres espléndidas salas para exposiciones temporales y el taller de los niños. Allí se encuentra también la sede de la Asociación de Entidades Culturales de Antioquia, ASENCULTURA.

El proyecto inmediato es crear la Escuela de Artes y Oficios, con el fin de brindar cursos libres de educación no formal relacionados con el arte, la cultura y la historia, a niños y adultos, conocedores o simplemente, con inquietudes en torno a los temas ofrecidos. Los trabajos de construcción ya están en marcha.

Con todos estos servicios, el Museo pretende revitalizar la sede y generar un impacto positivo en la zona de La Veracruz, que fortalezca el que ya se ha originado desde la sede principal y la Plaza Botero.

La instalación de la escultura El Prometeo encadenado, del maestro Rodrigo Arenas Betancur, en la fachada del edificio, es un símbolo de esa vitalidad que se pretende para el Ala Experimental. La escultura, cedida en comodato por Bancolombia, ocupará su lugar en el paredón de la calle Calibío durante la última semana de diciembre de 2004..